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牡丹种质资源库项目在洛阳建立实施以来，为洛阳牡丹种质资源保存、驯化繁育、开发利用等方面做出了重要贡献。项目建设单位多次获国家、省、市级科技成果奖，多次在世界园艺博览会上获得金奖、大奖。2017年“中原牡丹核心种质构建及新优品种繁育关键技术”获河南省科学技术进步二等奖，2019年4月，北京世界园艺博览会上获得特等奖6个，金奖14个，银奖20个，铜奖28个，优秀奖2个，合计获70个奖项。2019年10月“牡丹新品种培育及提质增效关键技术创新与应用”项目获得河南省科学技术进步一等奖。

国家林木种质资源库项目的实施，在新品种培育方面也取得突破，采用牡丹种群之间的杂交方法及牡丹组与芍药组之间的远源杂交方法，确定了培育花期晚、花色奇特、抗逆性强的育种目标，选育出了一批新品种。2017年11月，通过中国花卉协会牡丹芍药分会，登录了6个牡丹品种：‘黄焰’‘黄蝶’‘橙色年华’‘金阁迎夏’‘粉玲珑’‘粉扇’。 2021年5月，通过中国花卉协会牡丹芍药分会，登录了11个牡丹新品种：‘春神’‘变叶墨香’‘艳阳春’‘墨椀金盘’‘祥瑞天使’‘河洛春’‘月中仙子’‘河洛锦绣’‘洛神奇花’‘古都彩蝶’‘古都锦绣’。